Affymetrix Rhesus Macaque Genome Array 恒河猴
恒河猴基因芯片组点可以检测2004年10月前报道的Genbank, dbEST 和Unigene数据库中的47000个转录子，以及一些相关病毒的基因。
人CGH芯片2.1M,人全基因组CGH芯片,人比较基因组杂交芯片
人CGH芯片2.1M,人全基因组CGH芯片,人比较基因组杂交芯片Human CGH 2.1M Whole-Genome Tiling v2.0D Array
长链非编码RNA芯片
ncRNA研究的重要一步是发现与特定疾病相关的lncRNA。传统的lncRNA筛选方法（SELEX等）效率低下，假阳性率高。而基因芯片具有覆盖全面、高效、准确的特点
Affymetrix Plasmodium/Anopheles Genome Array 疟原虫
该芯片包括约4,300 Plasmodium falciparum 的转录子和约14,900 Anopheles gambiae 转录子。
实时荧光定量PCR
实时荧光定量PCR可以在反映处于指数期时，检测PCR产物的量，由此推断初始模板。实时荧光定量PCR使用的荧光化学主要分为两种类型：荧光探针法和荧光染料法。
Affymetrix Canine Genome 2.0 Array 狗
该芯片可以检测18,000个犬的mRNA/EST转录子，和超过20,000个非冗余的预测基因。